ソフトウェア、パッケージ、APP– category –
主にバイオインフォマティクスで使用するソフトウェアやパッケージ、APPのインストール方法や使用方法などの解説
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Biopythonのインストールと使用方法
【インストール】 Biopythonは塩基配列やタンパクの配列を読み込み簡単に編集できるようにするためのパッケージです(他にも色々できます)。公式ページ(https://biopy... -
NCBIからゲノムデータをダウンロードする(ncbi-genome-download)
【はじめに】 NCBIからゲノム情報をダウンロード(genbank, fastaファイルの取得)するにはWEBからポチポチやるのが一般的だとは思うのですが、ダウンロード数が100個... -
Jupyter notebook(lab) のインストールと動作確認まで
【はじめに】 jupyter notebookをインストールと起動確認を行います *注 2022年現在はJupyter notebookの後継であるJupyterLabがおすすめみたいです。 Jupyter notebo... -
pythonのインストール
バイオインフォマティクスを本格的にやるためにはpythonは必須です。Ubuntuにはもともとpythonがインストールされていますが、システムの方で使用していることと、少し...
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